新甲型H1N1流感病毒血凝素基因(HA)突变网络结构
何云刚1, 丁国徽1, 边超1, 黄忠1, 蓝柯1, 孙兵1, 王学才1, 李亦学1,9, 王红艳2, 王小宁2,8, 杨忠2,9,钟扬2,9, 金维荣3,14, 熊慧3, 戴建新4,5, 郭亚军4,5, 王皓4,5, 车小燕7, 吴凡8, 袁政安8, 张曦8,曹志伟9,10, 周晓农11, 周佳海12, 马志永13, 童光志13, 赵国屏1,2,3,14, 金力1,2,3
1 中国科学院上海生命科学研究院CAS-MPG计算生物学伙伴研究所计算生物学重点实验室、系统生物学重点实验室生物信息中心、植物生理生态研究所合成生物学实验室、巴斯德研究所, 上海 200031;
2 复旦大学生命科学学院, 上海 200433;
3 国家人类基因组南方研究中心, 省部共建国家重点实验室培育基地-上海市疾病与健康基因组学实验室, 上海 201203;
4 第二军医大学肿瘤研究所, 上海 200433;
5 华南理工大学生物科学与工程学院, 广州 510641;
6 抗体药物国家工程研究中心, 上海 201203;
7 南方医科大学珠江医院, 广州 510282;
8 上海市疾病预防控制中心, 上海 200336;
9 上海生物信息技术研究中心, 上海 200235;
10 同济大学生命科学与技术学院, 上海 200092;
11 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所, 上海 200025;
12 中国科学院上海有机化学研究所, 上海 200032;
13 中国农业科学院上海兽医研究所, 上海 200241;
14 上海生物芯片公司生物芯片上海国家工程研究中心, 上海 201203
构建了新甲型H1N1流感病毒血凝素基因的变异网络图. 同源性比对表明, 来自墨西哥的一个病毒序列类型为此次新流感病毒的原始序列类型. 通过血凝素基因658A和1408T突变可将此新流感病毒序列分为墨西哥类型、过渡类型和纽约类型3个主要类型. 这3个类型在地理分布上具有明显差别.