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基因调控系统中反馈压制的噪声: 慢转录情形
苑占江,张家军,周天寿*
中山大学数学与计算科学学院, 广州 510275
对于基因调控系统, 噪声与反馈之间的关系一直是令人关注的话题. 本文以基本的正负反馈环路为模型, 同时考虑了一个重要但被以往研究忽视的因素: 非平衡基因状态波动或慢转录过程(如在真核细胞中), 研究了反馈对噪声的效果, 导出了修正的波动-耗散关系, 显示出慢转录过程的速率对噪声与反馈之间的关系有重要影响. 主要的定性影响包括: 在无反馈情形, 慢转录总是扩大内部噪声, 但这种扩大效果随着慢转录过程速率的不断变大而逐渐消失, 然而慢转录对外部噪声没有影响; 相反地, 负反馈在慢转录情形总是减低内部噪声, 但减低的程度依赖于慢转录过程的速率, 而正反馈在慢转录情形总是同时扩大内部噪声和减低外部噪声, 但扩大或减低的程度依赖于慢转录过程的速率. 此外, 用Gillespie算法验证了理论预测. 本研究为从生物物理学的角度理解噪声信号在自然网络中是如何传播的奠定了基础, 也对理解细胞内部过程有指导意义.
国家自然科学基金重点和面上项目(批准号: 60736028, 30973980)资助